LAMMPS里的溫度是靠原子動能算出來的，具體可以看官方手冊里compute temp那部分。
我們平時用dump命令輸出的lammpstrj文件，里面存了每個原子在各個時刻的位置、速度、動能、勢能這些信息（當然得在dump里設好了才會存）。只要你這個文件里有動能數據，畫溫度分布圖就沒問題。
推薦一個方法：用OVITO導入lammpstrj然后上色。
OVITO是專門處理LAMMPS結果的免費軟件，Win和Linux都能用，搜一下官網就能下。它能按原子的某個屬性來上色，比如x坐標、動能啥的，操作特別簡單。不過缺點是圖出來是球狀原子模型，屬于離散的點，不是那種連續平滑的分布圖。比如有張圖顯示石墨被C60撞了之后表面溫度分布（側面視角），每個原子的溫度都標出來了，看得清清楚楚。
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